סן פרנסיסקו 49 בחרה לראשונה בדראפט 2026 כשבחרה את הרץ הרחב דה-ז'ון סטרבלינג בסיבוב השני במקום ה-33 הכללי. הבחירה התבצעה לאחר שהקבוצה ביצעה שתי עסקאות החלפה בלילה של יום חמישי.

סטרבלינג, בוגר אוניברסיטת אול מיס, רשם בעונה האחרונה 55 תפיסות ל-811 יארדים ושישה טאצ'דאונים. לפני שהצטרף לאול מיס, שיחק גם באוניברסיטת אוקלהומה סטייט ובאוניברסיטת וושינגטון סטייט.

הקבוצה ביצעה מספר צעדים משמעותיים במהלך הפגרה: היא החתימה את הרצים מייק אוונס וכריסטיאן קיר, וכן שמרה על ריקי פירסול לעונה נוספת. עם זאת, ברנדון איוק עדיין נמצא בסגל, אך הקבוצה צפויה להורידו מסדר העומק בקרוב.