Jeep Wagoneer memasuki titik krusial pada tahun 1984. Pada saat itu, AMC (American Motors Corporation) melakukan rebranding terhadap model Wagoneer Limited menjadi Grand Wagoneer. Sementara itu, model baru XJ Cherokee diluncurkan dengan trim mewah dan diberi nama Wagoneer serta Wagoneer Limited untuk segmen yang lebih premium.
Tujuan utama AMC adalah menggantikan Wagoneer model SJ (Superior Jeep) dengan XJ Cherokee di semua lini. Namun, strategi ini tidak berjalan mulus. Meskipun sukses untuk model Cherokee, Wagoneer XJ justru gagal menarik minat pasar. Penjualan model baru ini tidak pernah mencapai 25.000 unit per tahun dan terus menurun dengan cepat. Di sisi lain, Grand Wagoneer yang sudah ada tetap laris dan menguntungkan, memaksa AMC untuk tetap memproduksinya.
Pada peluncuran XJ Wagoneer, lini SJ dikonsolidasikan dari dua trim menjadi satu. Model Brougham dihentikan, dan Wagoneer Limited berganti nama menjadi Grand Wagoneer. Namun, pada pertengahan 1984, Jeep meluncurkan trim Wagoneer Custom yang menjadi eksperimen singkat dan tidak lazim.
Wagoneer Custom merupakan versi yang lebih sederhana dibandingkan Grand Wagoneer. Trim ini tidak dilengkapi trim kayu di bagian eksterior dan menggunakan velg baja dengan penutup roda. Peralatan standarnya jauh lebih minim, dan sistem penggeraknya hanya menggunakan empat roda penuh waktu (part-time) tanpa Selec-Trac. Harganya pun jauh lebih terjangkau, yaitu $15.995 (setara dengan $51.832 saat ini) atau sekitar $3.000 (setara dengan $9.721 saat ini) lebih murah dibandingkan Grand Wagoneer.
Minat konsumen terhadap Wagoneer Custom sangat rendah. Trim ini hanya bertahan beberapa bulan sebelum akhirnya dihentikan. Meskipun demikian, Wagoneer Custom menjadi salah satu model Jeep yang langka dan memiliki tampilan yang sangat berbeda dari model lainnya.
Dari segi tampilan, Wagoneer Custom mempertahankan fascia model Wagoneer terbaru tetapi tanpa trim kayu atau emblem script. Dengan menggunakan penutup roda dasar, tampilan sederhana ini justru menonjolkan desain bodi model tahun 1960-an yang sudah tua. Terdapat strip trim hitam di sepanjang sisi untuk menyamarkan tampilan bodi yang sangat polos. Interiornya pun tidak kalah sederhana. Panel pintu menggunakan desain lama dengan sedikit bantalan dan karpet, serta sisipan kain. Jendela dan kursi dioperasikan secara manual, dan kursinya menggunakan jok kain (dengan motif houndstooth) alih-alih kulit.
Setelah setengah tahun beredar, trim Wagoneer Custom akhirnya dihentikan. Grand Wagoneer kembali menjadi satu-satunya pilihan utama hingga tahun 1985. Pada tahun tersebut, Jeep melakukan pembaruan pada sistem suspensi, termasuk perubahan pada batang penstabil depan, peredam kejut yang didesain ulang, dan pegas belakang yang direvisi.
Pada tahun 1986, Grand Wagoneer SJ menjalani pembaruan visual terakhir. Bagian depan mengalami perubahan signifikan dengan penggantian grille yang sebelumnya bertingkat menjadi desain horizontal datar dengan tiga bagian horizontal berbahan krom. Di dalamnya terdapat bilah horizontal tipis.